拉米夫定、替比夫定、恩替卡韦以及阿德福韦酯经治耐药或应答欠佳患者可换用TDF抗病毒治疗。
一项纳入例对使用2种或2种以上拉米夫定、替比夫定、恩替卡韦或阿德福韦酯治疗但疗效欠佳CHB患者的研究显示，转换至TDF单药治疗，第12、24、48和72周时，分别有57.4%、69.6%、74.8%和86.1%的患者发生病毒学应答。
尽管有研究认为拉米夫定和(或)阿德福韦酯耐药不影响TDF的疗效，但在单独纳入ADV应答不住或耐药CHB患者的研究中，阿德福韦酯耐药为TDF不易获得病毒学应答的独立预测因素，因而这类人群TDF不宜作为首选。
一项研究纳入92例对原来核苷类药物原发无应答、部分应答或发生病毒学突破的CHB患者，58%存在单药耐药或多重耐药的证据，转换至ETV(10mg/d)+TDF联台冶疗，48周和96周时的病毒学应答率分别为76%和85%，没有观察到治疗诱发的ETV或TDF耐药。临床一般根据病毒变异结果选择单药TDF或与恩替卡韦联合方案。
TDF可用于母婴阻断和孕期乙肝肝炎活动的治疗。
TDF在药物妊娠分类中属于B级，即在动物繁殖性研究中(并未进行孕妇的对照研究)，未见到对胎儿的影响，或者在动物繁殖性研究中表现有副作用，这些副作用并未在妊娠3个月的妇女得到证实也没有对其后6个月危害性的证据。
在大鼠和家免中进行的生殖毒性研究显示，在人的14和19倍剂量下，没有证据表明因为TDF造成生育能力损伤或对胎仔有伤害。然而，由于没有在妊娠妇女中进行过充分及良好对照的研究，已发表的少量研究对娩出胎儿的观察时间也不够长。
出于动物生殖研究并不是总能预测人的反应的考虑，厂家给出的说明书上建议妊娠期间不应使用富马酸替诺福韦二吡呋酯，除非十分需要。但基于TDF在HIV感染人群中的使用经验和B级抗病毒药选择有限的前提，乙肝诊治指南建议可在充分知情同意前提下用于妊娠期HBV感染炎症活动患者的抗病毒治疗和妊娠中晚期HBV感染母婴垂直传播阻断，目前不建议服用TDF期间哺乳，但存在争议，可在不违背伦理的前提下积累数据，将来给出明确意见。
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