文章来源
中华肝脏病杂志,,28(9):-
作者:
杨双燕任红李传飞汤慧
DOI:10./cma.j.cn-0818-
摘要
目的
通过生物信息学方法筛选出参与肝细胞癌(HCC)进展的核心基因(Hubgene),探讨细胞周期蛋白B2(CCNB2)在HCC发生发展及预后中的潜在作用。
方法
从GEO数据库中筛选并下载四个HCC相关数据集,用GEO2R分析数据并鉴定差异表达基因(DEG)。利用DAVID数据库对DEGs进行GO分析,Cytoscape的ClueGO插件完成KEGG信号通路富集分析,并将DEGs导入STRING数据库建立蛋白相互作用(PPI)网络图,用Cytoscape对PPI网络进行可视化,构建关键模块(cluster)和筛选核心基因。分别使用UCSC数据库和UALCAN数据库完成核心基因在TCGA肝癌中的差异表达分析和生存分析。使用Firebrowse,On